Дастури истифодабарандаи iMed
Муқаддима
1.1. Мақсад
Максад аз ин web ариза ин гирифтани иттилооти хом ва имкон додани коркарди он ба тарзе, ки дар қабули қарор натиҷаҳои муфид медиҳад. Ин метавонад барои омӯзиши модел бо маълумоти хом ё пешгӯии натиҷа бо истифода аз моделҳо ва таҳлилҳо бошад.
1.2. Менюи навигатсионӣ
Менюи навигатсионӣ дар болои саҳифа ҳамаи истинодҳоро дар бар мегирад, то ба ҷое, ки шумо лозим аст, дастрас шавед. Агар шумо ягон вақт гум шавед, шумо ҳамеша метавонед тирчаи қафоро пахш кунед, то ба саҳифаи шинос равед, ба хона баргардед ё саҳифаеро, ки дар менюи навигатсионӣ ҷустуҷӯ мекунед, пайдо кунед.
1.3. Ҳисоб
Агар шумо аллакай ҳисоб надошта бошед, шумо бояд барои истифодаи барнома сабти ном кунед. Барои ин, тугмаи ҳисобро дар тарафи рости боло пахш кунед ва ба қайд гиред. Пас номи корбар, парол ва почтаи электронии худро ворид кунед, то идома диҳед.
Агар шумо аллакай ҳисоб дошта бошед, бо номи корбар ва пароли худ ворид шавед.
Саҳифаи асосӣ
Бо пахш кардани ҷузъҳои дар тарафи чапи саҳифа, тавсифи ҳар яки онҳо дар мобайни саҳифа пайдо мешавад, то ба шумо фаҳмед, ки ҳар кадоми онҳо чӣ кор мекунад.
iMedBot
Замимаи iMedBot интерфейсеро пешкаш мекунад, ки ба ҳамкории осони корбар бо агентҳо мусоидат мекунад ва имкон медиҳад, ки пешгӯии фардӣ ва омӯзиши моделиро фароҳам орад. Он ҳамчун қадами аввалин дар самти табдил додани натиҷаҳои таҳқиқоти амиқ ба воситаи онлайн хидмат мекунад, ки потенсиали ба ҷустуҷӯҳои иловагии тадқиқотӣ дар ин доменро фароҳам меорад. Дастури корбарии онро дар ин ҷо пайдо кардан мумкин аст.
Таҳлили маълумот
4.1. Зермаҷмӯҳоро дарёфт кунед
Ин бахш ба корбар имкон медиҳад, ки маҷмӯи додаҳои худро таҳрир кунад. Шумо метавонед интихоб кунед, ки маҷмӯаи маълумоти навро бор кунед ё аз менюи афтанда истифода баред.
Пас аз бор кардани маҷмӯи маълумот, шумо метавонед бо пахш кардани яке аз имконоти дар менюи чапи чап кадом амалеро иҷро кардан мехоҳед.
4.1.1. Зермаҷмӯҳоро дар асоси филтрҳо дарёфт кунед
Ин бахш имкон медиҳад, ки як зермаҷмӯи хурдтари маҷмӯи додаҳои аслӣ дар асоси филтрҳои додашуда гирифта шавад. Арзишҳоеро, ки дар зермаҷмӯа мехоҳед, интихоб кунед ва сипас сутунҳоеро, ки мехоҳед дар маҷмӯи маълумоти ниҳоӣ нишон диҳед, интихоб кунед.
4.1.2. Баргардонидани натиҷаҳои мураттабшуда
Ин маҷмӯи маълумотро дар шакли мураттабшуда бармегардонад. Сутуни мақсаднок, тартиби ҷудокунӣ, шумораи сатрҳоро барои баргардонидан ва кадом сутунҳоро дар натиҷаи ниҳоӣ нишон диҳед.
4.1.3. Маҷмӯи маълумотро васеъ кунед
Ин ба корбар имкон медиҳад, ки сутуни ягонаи ҳамчун луғат ҳифзшударо ба ҷадвали воқеӣ васеъ кунад, ки корбар метавонад онро идора кунад. Он маҷмӯи додаҳои лонаро мегирад ва он чизеро, ки корбар талаб мекунад, ба қабати боло интиқол медиҳад. Аввалан, маҷмӯи додаҳоро бор кунед, ки сутуни дорои маҷмӯи додаҳои лонаро дар бар мегирад. Агар сутуне, ки ба васеъшавӣ ниёз дорад, ба таври худкор муайян карда шавад, кадом сутунро васеъ кардан ва кадом сутунҳоро аз маълумоти лона гирифтан интихоб кунед. Ирсолро пахш кунед ва шумо метавонед view маълумоти шумо ҳамчун сутунҳои ҷадвал ба ҷои маълумоти лона гузошташуда.
4.2. Якҷоя кунед Files
Бо интихоб ва бор кардани маҷмӯи маълумотҳои сершумор тавассути клики ctrl (фармони барои mac), ин онҳоро ба як маҷмӯи додаҳои калонтар аз он ки барои чизи дигар истифода мешавад, муттаҳид мекунад.
Танҳо ҳамаи маҷмӯи маълумотро интихоб кунед ва маълумоти заруриро пур кунед. Ин маҷмӯи додаҳои навро дар замимаи iMed захира мекунад ва сипас барои зеркашӣ дастрас аст.
4.3. Функсияҳои сюжет
Ин бахш ба корбар имкон медиҳад, ки маҷмӯаи додаҳои худро тарҳрезӣ кунад. Яке аз имконоти менюи тарафи чапро интихоб кунед ва пас барои гирифтани қитъаи худ майдонҳои заруриро пур кунед. Дар зер намудҳои қитъаҳое ҳастанд, ки шумо метавонед аз маълумоти худ созед:
4.4. Таҳлили оморӣ
Ин бахш ба мо имкон медиҳад, ки дар маҷмӯаи маълумотамон санҷишҳои оморӣ гузаронем. Барои иҷро кардани менюи тарафи чап санҷишеро интихоб кунед ва майдонҳоро барои иҷро кардани санҷишҳо пур кунед. Дар зер намудҳои санҷишҳои дастрас мавҷуданд:
ODPAC
5.1. Омӯзед
Ин саҳифа тавсифи мухтасари ҳар як намуди захираҳои дар ин саҳифа мавҷудбударо дар бар мегирад. Ангуштзании тугма дар болои ҳар як бахш ба саҳифаи дигар пайваст мешавад, ки ба корбар имкон медиҳад, ки дар бораи мавзӯъ истифода ё бештар омӯзад.
5.1.1. Эпистаз
Ин саҳифа ба мо имкон медиҳад, ки MBS, алгоритми ҷустуҷӯро барои омӯхтани маълумот истифода барем. Махсусан, он ба мо имкон медиҳад, ки эпистаз, таъсири мутақобилаи ду ё зиёда генҳоро, ки ба фенотип таъсир мерасонанд, омӯзем. Ин барои профессионал муфид астfile бемориҳо дар ҷанбаи генетикӣ. Усулҳои анъанавӣ барои коркарди маълумоти баландандоза, ки дар таҳқиқоти ассотсиатсияи умуми геном (GWAS) пайдо шудаанд, мувофиқ нестанд. Алгоритми Ҷустуҷӯи Multiple Beam (MBS) имкон медиҳад, ки генҳои мутақобила бо суръати хеле тезтар муайян карда шавад. Маълумотеро, ки шумо мехоҳед истифода баред, бор кунед ва майдонҳои лозимиро ворид кунед. Барои маълумоти амиқтар, коғази пурраро дар ин ҷо пайдо кунед.
5.1.2. Омилҳои хавф
Ин саҳифа ба мо имкон медиҳад, ки бастаи IGain-ро барои омӯхтани муносибатҳои байни додаҳо истифода барем. Он махсусан бо истифода аз ҷустуҷӯи эвристикӣ амалҳои мутақобиларо аз маълумоти баландандоза меомӯзад. Ин усул ба усули Exhaustive_IGain асос ёфтааст, ки қаблан барои омӯхтани таъсири мутақобила аз маълумоти камченака таҳия шудааст. Маълумотро бор кунед ва сипас майдонҳои заруриро ворид кунед. Маълумоти бештарро дар бораи ҳадди ниҳоии IS ва iGain дар ин ҷо пайдо кардан мумкин аст.
5.1.3. Моделҳои пешгӯӣ
Ин бахш имкон медиҳад, ки моделҳои пешгӯии аллакай дар болои моделҳои омӯзиши мошинсозӣ сохташуда барои суръат бахшидан ба истифодаи он. Ин имкон медиҳад, ки онҳо бидуни истифодаи рамзгузорӣ ва таҷрибаи қаблӣ барои пешгӯии моделҳо бо истифода аз маҷмӯи додаҳои худ истифода шаванд. Якчанд моделҳои пешгӯӣ барои корбар дастрасанд, аз ҷумла Логистикӣ, Регрессия, Мошинҳои Вектории Дастгирӣ (SVMs), Дарахтони Қарорҳо ва бисёр чизҳои дигар. Рӯйхати пурраи усулҳои пешгӯӣ дар тарафи рости саҳифа дар ин ҷо пайдо мешавад.
5.2. Пешгӯӣ
Ин бахш имкон медиҳад, ки пешгӯиҳо аз модели муштараки қаблан боршуда. Аввалан модели муштаракро бор кунед, агар ин корро накарда бошад. Сипас бо пахш кардани номи модел моделеро интихоб кунед, ки барои пешгӯӣ истифода мешавад. Сипас маълумотро барои модели пешгӯӣ барои истифода бор кунед. Ин мумкин аст ё ба таври дастӣ бо истифода аз шакли дар поёни саҳифа ё бо истифода аз қолаби барои боргирӣ дастрас анҷом дода мешавад. Агар қолабро истифода баред, маҷмӯи маълумотро бор кунед file ва барои гирифтани пешгӯии модел пахш кунед.
5.3. Дастгирии қарор
Дастгирии қарор таснифро таъмин мекунад ва метавонад интихоби табобатро аз маълумоти ба система пешниҳодшуда роҳнамоӣ кунад. Он аз маълумот омӯхта шудааст, то тартиби оптималии табобатро дар асоси хусусиятҳои бемор тавсия диҳад. Маълумоти бештарро дар бораи системаҳои дастгирии қарорҳои клиникӣ (CDSS) дар ин ҷо пайдо кардан мумкин аст.
Тавсияи система хусусиятҳои беморро мегирад ва тартиби табобатро тавсия медиҳад ва эҳтимолияти ояндаи метастазҳои 5-соларо пешгӯӣ мекунад. Дахолати корбар ҳам хусусиятҳои бемор ва ҳам тартиби табобатро барои пешгӯии эҳтимолияти ояндаи метастазҳои 5-сола дар асоси табобати ҷорӣ ба ҷои табобати оптималӣ мегирад.
МБИЛ
Markov Blanket and Interactive Risk Factor Learner (MBIL) як алгоритмест, ки омилҳои хатари ягона ва интерактивиро меомӯзад, ки ба натиҷаи бемор таъсири мустақим доранд. "Гаридан ба MBIL" -ро клик кунед, то ба Индекси бастаи Python (PyPI) барои бастаи MBIL, ки дар ин ҷо ҷойгир аст, равона карда шавад. Маълумоти бештарро дар бораи MBIL дар BMC Bioinformatics пайдо кардан мумкин аст.
Маҷмӯи додаҳо
Ин бахш ба корбар имкон медиҳад, ки маҷмӯи додаҳои навро бубинад ва бор кунад web ариза.
7.1. Ҳамаи маҷмӯи маълумотҳои дастрасро бубинед
Барои дидани ҳама маҷмӯи додаҳои дастрас, танҳо клик кунед "Намоиш додани маҷмӯи додаҳои дастрас".
7.2. Маҷмӯи маълумотро бор кунед
Барои бор кардани маҷмӯаи додаҳо, "Маҷмӯи додаҳои худро мубодила кунед" -ро клик кунед ва сипас маълумоти заруриро тавре, ки дар он гуфта шудааст, пур кунед. webсаҳифа. Аввалан, маҷмӯи маълумотро бор кунед ва майдонҳои заруриро пур кунед.
Сипас, майдонҳои зерро пур кунед ё матнро бор кунед file бо маълумоти пур. Як собиқample дар бораи чӣ гуна ташкил кардани иттилоот, то барнома онро фаҳмад, дар зер оварда шудааст.
Моделҳо
Ин бахш ба корбар имкон медиҳад, ки моделҳои барои онҳо дастрасро бубинад ва моделро мубодила кунад.
8.1. Ҳамаи моделҳои дастрасро бубинед
Барои дидани ҳамаи моделҳои дастрас, клик кунед "Намоиш додани моделҳои дастрас".
8.2. Мубодилаи модел
Барои мубодилаи модел, "Моделҳои худро мубодила кунед" -ро клик кунед ва сипас моделро бор кунед file бо ҷараёни тензор ё PyTorch таълим дода мешавад.
8.2.1. Маҷмӯи додаҳои марбут
Пас шумо бояд маҷмӯи додаҳои марбутро, ки сарлавҳаҳоро дар бар мегирад, бор кунед. Синф/тамғаи маҷмӯи додаҳо бояд дар сутуни охирин бошад.
8.2.2. Пешгӯиҳо ва маълумоти синф
Агар маҷмӯи додаҳо тамоми хусусиятҳоро дар бар гирад, пас аз боркунии маҷмӯи додаҳо шакли хусусиятро партофтан мумкин аст. Аммо, агар ҳамаи онҳо дохил нашаванд, ин маълумот бояд дар тавсиф пешниҳод карда шавад file ё дар дохили шакли хусусият. Интихобро аз афтанда интихоб кунед, ки нишон медиҳад, ки чӣ гуна шумо пешгӯиҳо ва маълумоти синфро пешниҳод кардан мехоҳед.
Агар имконоти тавсифро истифода баред, шумо метавонед майдонҳоро пур кунед ё матнро бор кунед file бо маълумоти пур. Як собиқample дар бораи чӣ гуна ташкил кардани маълумот дар зер оварда шудааст.
Ҳуҷҷатҳо / Сарчашмаҳо
 |
Барномаҳо iMed Web Ариза [pdf] Дастури корбар iMed, iMed Web Ариза, Web Ариза |